市委臺灣工作辦公室與市政府臺灣事務辦公室爲一個機構，兩塊牌子，正縣級部門管理機構，下設秘書處、經濟處和交流聯絡處。

　　市台辦的主要職責有：組織、指導、管理、協調全市對台工作。檢查瞭解各縣區、各部門貫徹執行對台方針政策和市委、市政府對台工作部署的落實情況。加強對台經貿和吸引台資工作。協調有關部門處理台資企業糾紛和台商投訴工作。做好台資企業協會的管理工作。協調和指導合台之間金融、科技、文化、教育等各領域的交流與合作。負責全市對台宣傳、涉台教育和有關對台工作的新聞發佈。負責管理台灣記者來肥採訪和涉台新聞報道稿件和音像製品工作。協助有關部門辦理臺胞回肥定居工作。負責全市臺胞臺屬工作。開展對台聯誼活動。負責臺胞捐贈及報批工作。負責全市對臺灣中上層人士的聯絡工作。協調處理全市涉台的重大活動，協調處理全市涉台重大事項和突發事件。