市委台湾工作办公室与市政府台湾事务办公室为一个机构，两块牌子，正县级部门管理机构，下设秘书处、经济处和交流联络处。

　　市台办的主要职责有：组织、指导、管理、协调全市对台工作。检查了解各县区、各部门贯彻执行对台方针政策和市委、市政府对台工作部署的落实情况。加强对台经贸和吸引台资工作。协调有关部门处理台资企业纠纷和台商投诉工作。做好台资企业协会的管理工作。协调和指导合台之间金融、科技、文化、教育等各领域的交流与合作。负责全市对台宣传、涉台教育和有关对台工作的新闻发布。负责管理台湾记者来肥采访和涉台新闻报道稿件和音像制品工作。协助有关部门办理台胞回肥定居工作。负责全市台胞台属工作。开展对台联谊活动。负责台胞捐赠及报批工作。负责全市对台湾中上层人士的联络工作。协调处理全市涉台的重大活动，协调处理全市涉台重大事项和突发事件。